Przewalskihästen skiljer sig en del från dagens modernare hästar, bland annat då den har 66 kromosomer istället för de 64 som dagens hästar har. Detta hindrar dock inte rasen från att kunna ge fertil avkomma vid korsning med tamhästar (vilket till exempel åsnor inte kan på grund av större skillnad i kromosomerna).
The karyotype of Przewalski's horse differs from that of the domestic horse, having 33 chromosome pairs versus 32, apparently due to a fission of a large chromosome ancestral to domestic horse chromosome 5 to produce Przewalski's horse chromosomes 23 and 24, though conversely, a Robertsonian translocation that fused two chromosomes ancestral to those seen in Przewalski's horse to produce the single large domestic horse chromosome has also been proposed.
En häst förde dem samman. Var? När? Vad hette hästen?